Administrativt er Rygge kommune organisert etter en tre-nivå modell. Kommunestyret delegerer myndighet til rådmannen med rett til å videredelegere til kommunalsjefer og personal- og organisasjonssjef samt økonomisjef. Kommunalsjefene kan delegere myndighet videre til enhetsledere.

Kommunen har i dag 16 virksomheter som ledes av enhetsledere og som rapporterer til kommunalsjefene.

Rådmannen er den øverste leder for den samlede kommunale administrasjon.